Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms