Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS72Q15906 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
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