Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SEC23BQ15437 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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