Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms