Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3HDM1Q15032 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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