Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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COL9A2Q14055 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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COL9A2Q14055 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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