Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXOSC2Q13868 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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