Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PMS2P11Q13670 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms