Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTCH1Q13635 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTCH1Q13635 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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