Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CUL1Q13616 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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