Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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