Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSLNQ13421 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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