Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGCGQ13326 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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