Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCGB2A2Q13296 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms