Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGDRQ13258 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms