Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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