Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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