Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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IFT88Q13099 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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IFT88Q13099 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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IFT88Q13099 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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IFT88Q13099 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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