Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACACAQ13085 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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