Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms