Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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GRIK3Q13003 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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GRIK3Q13003 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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GRIK3Q13003 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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