Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms