Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCAPQ12770 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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