Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC15Q0P6D6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms