Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms