Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms