Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL9Q07325 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms