Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms