Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FMODQ06828 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FMODQ06828 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FMODQ06828 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms