Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTBQ06643 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms