Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OC90Q02509 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OC90Q02509 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OC90Q02509 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms