Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PLCB3Q01970 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms