Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms