Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms