Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCN7AQ01118 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms