Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF9Q00978 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms