Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MYBPC1Q00872 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms