Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms