Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO3P55854 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms