Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRPF1P55201 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms