Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPAP53621 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPAP53621 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPAP53621 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COPAP53621 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms