Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LUMP51884 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LUMP51884 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LUMP51884 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LUMP51884 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LUMP51884 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LUMP51884 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LUMP51884 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LUMP51884 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LUMP51884 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LUMP51884 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LUMP51884 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LUMP51884 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LUMP51884 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms