Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms