Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATRXP46100 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATRXP46100 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms