Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPOP42166 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPOP42166 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms