Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FDFT1P37268 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms