Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms