Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms