Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GJA4P35212 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GJA4P35212 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA4P35212 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA4P35212 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms