Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM5AP29375 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms